Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC174Q6PII3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms