Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms