Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms