Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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