Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms