Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms