Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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COL5A1-AS1Q5SY13 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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