Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms