Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms