Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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