Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PTPRNQ16849 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PTPRNQ16849 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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