Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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