Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FSCN1Q16658 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms