Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CTF1Q16619 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CTF1Q16619 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CTF1Q16619 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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