Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP6AP1Q15904 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms