Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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