Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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