Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms