Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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