Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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TNIP1Q15025 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNIP1Q15025 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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