Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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