Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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