Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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