Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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