Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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