Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms