Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms