Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms