Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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