Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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IFT88Q13099 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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IFT88Q13099 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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