Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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