Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms