Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDH17Q12864 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDH17Q12864 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDH17Q12864 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDH17Q12864 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDH17Q12864 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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