Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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