Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms