Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms