Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms