Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF9Q00978 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms