Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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