Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNA2P51530 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNA2P51530 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNA2P51530 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms