Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PXNP49023 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PXNP49023 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PXNP49023 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PXNP49023 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PXNP49023 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PXNP49023 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PXNP49023 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PXNP49023 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PXNP49023 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PXNP49023 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms