Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NESP48681 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NESP48681 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NESP48681 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NESP48681 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NESP48681 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms