Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms