Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRXP46100 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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