Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RECQLP46063 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RECQLP46063 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RECQLP46063 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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