Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms