Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms