Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZEB1P37275 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms