Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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