Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms